《奇迹少女》的情节主要围绕着生活在巴黎的普通少女玛琳娜展开。玛琳娜拥有一项异常奇妙的力量，她可以变身成为拥有神奇创造力的瓢虫少女。然而，在她的平凡生活中，突然闯入一位新的反派角色，这个反派在巴黎制造麻烦，威胁着这座美丽城市的和平。
玛琳娜被迫应对这一新挑战。但她并不孤身作战，她必须与她的宿敌，即黑猫诺尔合作。黑猫诺尔是一位神秘的超级英雄，拥有惊人的敏捷和力量，他的目标也是保护巴黎免受新反派的威胁。
他们必须同时学会如何克服彼此的差异，以及如何有效地利用各自的超能力。与此同时，他们还必须对抗这位新的反派，努力阻止他破坏巴黎的阴谋计划。他们是否能够成功，并且守护他们深爱的这座城市?这个问题将贯穿整个电影，为观众呈现一场紧张刺激的冒险，以及一段有关合作与勇气的故事。